Santo Tomás Cave, karstgrottsystem ved El Moncada i provinsen Pinar del Río, Cuba

Santo Tomás-grottene er et karstsystem hugget inn i en mogote i Sierra de Quemado, en del av Sierra de los Órganos, 18,6 km sørvest for Viñales ved landsbyen El Moncada. De 44,6 km kjente gangene fordeler seg på sju nivåer mellom 125 og 190 m høyde, til sammen 65 m. Det laveste nivået gjennomstrømmes fortsatt av bekken Santo Tomás, som forsvinner i Santo Tomás-dalen og kommer fram 2 km lenger borte i Quemado-dalen. Blant de navngitte salene er Salón del Caos med veldige nedstyrtede steinblokker.

Grotten har gitt forhistoriske funn: ristninger i cueva de Mesa og et menneskeskjelett på omkring 3 500 år i cueva de la Incógnita. Gerardo Mosquera foreslo i 1983 at petroglyfene i García Valdés-salen var av afrikansk utførelse, men senere arbeid med grottene Mesa, de los Petroglifos, la Iguana og la Cachimba fastslo en førkolumbisk opprinnelse. Stedet ble erklært som nasjonalmonument i 1989.

Bønder i området samlet tradisjonelt guano fra grotten for å bruke som gjødsel til tobakksavlingene sine. Denne praksisen knyttet grotten direkte til lokalt landbruk og dagligliv.

Besøkende kan bare utforske de tre første nivåene med sertifiserte guider, da grotten er beskyttet som et nasjonalt monument. Turene krever grunnleggende kondisjon, så besøkende bør forberede seg på de fysiske kravene på forhånd.

Det laveste nivået er fortsatt aktivt: bekken Santo Tomás renner inn fra Santo Tomás-dalen og kommer opp igjen 2 km senere i Quemado-dalen. En analyse fra 2014 viste at bakteriekonsentrasjonen falt fra 910 CFU/ml ved sluket til 217 CFU/ml ved kilden.