Museum Fatahillah, Historisk museum i Jakartas gamleby, Indonesia.

Museum Fatahillah er en treetasjes bygning med kremfargede vegger og grønne tredører i Jakartas gamleby. Inne finner besøkende historiske kart, tradisjonelle møbler, keramikk og mynter fordelt i rommene.

Bygningen ble oppført mellom 1707 og 1710 som Batavias rådhus og fungerte som administrativt senter i over to århundrer. Etter hvert ble den omgjort til et museum for å bevare byens fortid for offentlig forståelse.

Museet er oppkalt etter Fatahillah, lederen som i 1527 tok Sunda Kelapa fra portugiserne og ga byen navnet Jayakarta. Blant gjenstandene er en kopi av Van Linschotens bykart fra 1595 og en kanon kalt Si Jagur, som tidligere ble brukt i fruktbarhetsriter av kvinner som håpet å bli gravide.

Museet ligger i Jalan Kali Besar Timur 3 i Pinangsia, Taman Sari, Vest-Jakarta, i området Kota Tua. Transjakarta-holdeplassen Museum Sejarah Jakarta, tidligere Museum Fatahillah, betjener korridor 1 og 12 mot Kota og Tanjung Priok eller Sunter Kelapa Gading. I nærheten ligger Terminal Kota Tua, Kantor Pos Kota og Museum Wayang.

Bygningen har underjordiske celler som en gang fungerte som fengsel under Det nederlandske ostindiske kompanis styre med harde forhold. Disse rommene er fortsatt synlige i dag og avslører et mørkere kapittel i byens historie.